Plus de 120 espèces d'arbres poussent en Namibie: du Camel thorn en forme de parapluie (Acacia eroloba) au précieux Ana tree (Faidherba albida) avec ses fleurs blanches et cosses nutritives, importante source alimentaire pour les animaux du désert. Les arbres typiques du nord sont le mopane terminalis, le marula, le figuier géant, le baobab, le palmier Makalani et des espèces à bois comme le kiaat, le tamboti ou le teck du Transvaal. Dans le centre désertique et le sud, on trouve le kokerboom ou arbre à carquois (Aloe dichotma). Il y environ 200 espèces de plantes endémiques en Namibie, au nombre desquelles les lithops familièrement nommés "pierres qui fleurissent", et l'Aloe asperifoliia des régions désertiques. D'autres plantes méritant d'être nommées sont le curieux "pied d'éléphant" (Adenia pecuelii) et les "demi-hommes" (Pachypodium namaquanum) que l'on trouve à l'extrême sud, près de la rivière Orange.

Plus de 630 des 887 espèces d'oiseaux recensées en Afrique Australe sont aussi en Namibie. Parmi elles, près de 500 se reproduisent ici tandis que les autres sont des oiseaux migratoires. 11 de ces espèces sont endémiques, ce qui signifie que 75% de leur population mondiale se trouve en Namibie.

Particulièrement endémique sont le "Herero chat", le "Rockrunner", le "hornbill de Monteiro" et le "Damara tern" (99%). L'aigle pêcheur d'Afrique figure aussi sur les armoiries namibiennes. Enfin, d'intérêt particulier pour les visiteurs: les oiseaux tisserands, qui construisent des nids communaux dans lesquelles jusqu'à plusieurs centaines d'oiseaux peuvent vivre ensemble.